Жахлива і несподівана смерть. У спорткомплексі «Спартак-ЗІДМУ» минулих вихідних стартував традиційний турнір пам'яті народного депутата Олександра Кузнєцова (також, до речі, журналіста), який помер під час сесії Верховної Ради. Після поєдинку команд державної і приватної («Алекс») телекомпаній вийшли помірятися силами міні-футболісти газет «Запорозька Січ» і «Теленеделя». Сергій захищав ворота «січовиків». Лишалося грати кілька хвилин, як він, рятуючи свою команду від гола, витягнув «мертвого» м'яча. А сам iз підлоги вже не піднявся.
Заступник головного лікаря Центру екстремальної медицини Олег Великий сказав, що доставили Гончаренка в критичному стані: у нього були відсутні рефлекси. Серцеву діяльність, щоправда, вдалося відновити, однак о другій годині ночі журналіст помер. Експертиза констатувала крововилив у мозок. Попри свій молодий вік Сергій нажив важку хворобу судин, від якої, кажуть медики, Гончаренко до пори до часу міг і не потерпати. Його колеги ніколи не чули скарг на здоров'я (влітку Гончаренко витримував і не такі навантаження під час поєдинків з пляжного футболу).
Як розповів головний редактор «Запорозької Січі» Олександр Вєрьовкін, Сергій часто брався за журналістські розслідування, від яких відмовлялися інші газетярі. Професійна діяльність, вважають журналісти Запоріжжя, була причиною фізичної наруги над Гончаренком 3 вересня 2003 року. Силовики, ясна річ, тоді акцентували на версії «хуліганство». Від ножових поранень Сергій Гончаренко оговтався і з 1 лютого мав розпочати низку нових журналістських розслідувань у штаті редакції «Запорозької Січі». Не судилося.
Поховали журналіста на Осипенківському цвинтарі Запоріжжя.